Помимо геймплейных изменений авторы в Ground Zeroes доработали управление. Снейк больше не напоминает неуклюжего героя из скетча Дары О’Бриена, но некоторое время на притирку к ритму и управлению игры вам все же понадобится. Если вы знакомы с предыдущими частями MGS, у нас есть несколько хороших новостей: главный герой научился сам прислоняться к стенам, ускоряться на бегу и более-менее быстро прятаться в укрытие — смешно, но по меркам сериала это уже большой шаг вперед. Самое важное — во время обнаружения охранниками время слегка замедляется и у вас есть пара секунд чтобы хоть как-то исправить положение (например, вырубить ближайшего охранника). Невеликие по меркам других игр изменения в Ground Zeroes ощущаются как глоток свежего воздуха, и быстро превращают игру в самый удобный и отзывчивый выпуск серии.